Gracias a un artículo
$ gconftool-2 –shutdown
$ evolution –force-shutdown
$ cd
$ tar -cvzf evolution-backup.tar.gz .evolution .gconf/apps/evolution .gnome2_private/Evolution

Con esto hemos parado el servicio de gconf y evolution, nos hemos desplazado a nuestro directorio personal y hemos comprimido en “evolution-backup.tar.gz” el contenido de los directorios:

1. ~/.evolution/
2. ~/.gconf/apps/evolution/
3. ~/.gnome2_private/Evolution

Para recuperar el backup, simplemente habrá que descomprimirlo en el directorio personal del usuario.